O sorteio desta segunda eliminatória decorreu na terça-feira, 13 de setembro, na Cidade do Futebol, sendo estas as duas únicas equipas da Associação de Futebol de Santarém presentes, uma vez que as restantes ficaram pelo caminho na primeira ronda.
Na segunda ronda juntam-se aos participantes da 1.ª eliminatória, as equipas da Liga Portugal Sabseg 2, no total de 92 emblemas (16 da II Liga, 20 da Liga 3, 38 do Campeonato de Portugal e 18 oriundos das provas distritais).
42 clubes apuraram-se para a segunda eliminatória que se juntam aos 34 clubes que tinham ficado isentos no sorteio.
Os 18 emblemas da I Liga só entram na terceira eliminatória.